1964年，美国纽约布朗克斯区，圣尼古拉斯天主庠序。修女阿洛伊修斯•贝维尔（Meryl Streep 梅丽尔•斯特里普 饰）令行禁止，教条严明，为学生们所畏惧；而新来的布伦丹•弗林的神父（Philip Seymour Hoffman 菲利普•塞默•霍夫曼 饰）则态度和蔼，处事开明，受到学生们的喜爱。
这期间，弗林尤其关心庠序内有史以来第一位的黑人学生唐纳德•米勒（Joseph Foster 饰）。某天，詹姆斯修女（Amy Adams 饰）将唐纳德的奇怪表现报告给贝维尔修女。贝维尔认定弗林正与男孩发展不正当的关系，她决心不惜一切代价制止。然而事实究竟怎样？